রাজধানী ঢাকা শহরের এক মধ্যবিত্ত পরিবারে জন্ম জাকির হোসেন হাবীবের। শৈশব, কৈশোরের বেড়ে উঠার দিনগুলিও কাটে ঢাকা শহরেই। বাবা পরমানু শক্তি কমিশনে প্রশাসনিক কর্মকর্তা আর মা স্থানীয় শহীদ আবু তালেব উচ্চ বিদ্যালয়ের শিক্ষিকা ছিলেন। শিক্ষিত পরিবারের মধ্যে বেড়ে উঠা জাকির হোসেন শৈশবেই স্বপ্ন দেখতেন ডাক্তার হবেন। মেডিকেল কলেজের শিক্ষাজীবন পেরিয়ে উচ্চতর ডিগ্রি অর্জন করেছেন মাইক্রোবায়োলজিতে।বেশ কয়েক বছর মেডিকেল কলেজে শিক্ষকতা করে এখন তিনি আই ই ডিসি আর’ (Institute of Epidemiology Disease Control and Research) এ প্রধান বৈজ্ঞানিক কর্মকর্তা হিসেবে কর্মরত আছেন।